Název pracoviště:

Vykonavatel:

S členěním na tato pracoviště:

1

Centrum nádorové cytogenetiky ÚLBLD VFN

prof. Ing. Kyra Michalová, DrSc.

Pracoviště konvenční cytogenetické analýzy CNC ÚLBLD
Řešitel: prof. ing. Kyra Michalová, DrSc.

Pracoviště molekulárně genetické analýzy CNC ÚLBLD

Řešitel: doc. RNDr. Zuzana Zemanová, CSc.

2

Neuropsychiatrická skupina

prof. MUDr. Zdeněk Seidl, CSc.

Neuroradiologické oddělení (NMR)

Řešitel: prof. MUDr. Zdeněk Seidl, CSc.

Psychiatrická klinika

Řešitel: prof. MUDr. Jiří Raboch, DrSc.

3

Ústav dědičných metabolických poruch a Klinika dětského a dorostového lékařství

prof. MUDr. Jiří Zeman, DrSc.

Ústav dědičných metabolických poruch

Řešitel: MUDr. RNDr. Pavel Ješina, Ph.D.

Laboratoř pro studium mitochondriálních poruch KDDL

Řešitel: prof. MUDr. Jiří Zeman, DrSc.

4

III. Interní klinika VFN

prof. MUDr. Martin Haluzík, DrSc.

Laboratoř endokrinologie a metabolismu III. Interní kliniky,

Výzkumná metabolická skupina
Řešitel: prof. MUDr. Martin Haluzík, DrSc.

5

Trombotické centrum ÚLBLD VFN

prof. MUDr. Jan Kvasnička, DrSc.

Laboratoř molekulární genetiky trombotických stavů TC ÚLBD, řešitel ing. Jaroslava Hájková

Poliklinický úsek TC ÚLBD , vedoucí lékař doc. MUDr. Tomáš Kvasnička, CSc.

Laboratoř pro studium patologie hemostázy a stěny cévní TC ÚLBLD, řešitel prof. MUDr. Jan Kvasnička, DrSc.

Morfologické centrum CHL ÚLBLD – pracoviště imunofenotypisace, řešitel MUDr. Martin Špaček, Ph.D. 

6

Skupina Centrální výzkumné laboratoře Ústavu lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky, Klinika nefrologie a IV. interní klinika VFN

prof. MUDr. Tomáš Zima, DrSc.

Centrální výzkumné laboratoře Ústavu lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky

Řešitelé: prof. MUDr. Libor Vítek, Ph.D.

Klinika nefrologie

Řešitel: Prof. MUDr. Vladimír Tesař, DrSc.

Laboratoř pro výzkum aterosklerózy a Lipidová laboratoř IV. interní kliniky

Řešitel: prof. MUDr. Aleš Žák, DrSc.

7

Skupina Neinvazivní prenatální diagnostika (NPD) a Onkogynekologická chirurgie

prof. MUDr. Pavel Calda, Ph.D.

Gynekologicko-porodnická klinika

Řešitel: prof. MUDr. Pavel Calda, Ph.D.

prof. MUDr. David Cibula

Ústav biologie a lékařské genetiky

Řešitel: Ing. Aleš Hořínek, Ph.D.

8

Skupina Onkologická chirurgie

prof. MUDr. Zdeněk Krška, DrSc.

1. chirurgická klinika VFN

Víceleté projekty probíhající

1.     Centrum nádorové cytogenetiky

Vykonavatel: prof. Ing. Kyra Michalová, DrSc.

1.1 Stanovení nestability genomu nádorových buněk pomocí mikročipových technik a určení genů participujících při vzniku a progresi nádoru.

1.2 Strukturní chromosomové aberace, identifikace rekurentních zlomových míst a genů zahrnutých v přestavbách a posouzení jejich potenciální úlohy v patogenezi nádorových onemocnění a ve vývoji patologického klonu.

2.     Neuropsychiatrická skupina

Vykonavatel: prof. MUDr. Zdeněk Seidl, CSc.

2.1 Neuroradiologické oddělení (NMR)

Řešitel: prof. MUDr. Zdeněk Seidl, CSc.

2.1.1 Optimalizace monitorace léčby a predikce budoucího klinického zhoršení roztroušené mozkomíšní sklerózy pomocí konvenčních i experimentálních technik MR.

2.1.2 Optimalizace prenatální diagnostiky pomocí MR.

2.1.3 Vyšetřovací algoritmus u gynekologických nádorů.

2.1.4 Komparace MR srdce a echokardiografie.

2.2 Psychiatrická klinika

Řešitel: prof. MUDr. Jiří Raboch, DrSc.

2.2.1 Aplikace stimulačních metod - repetitivní transkraniální magnetické stimulace a transkraniální přímé elektrické stimulace v léčbě závažných duševních onemocnění.

2.2.2 Aplikace elektrokonvulzivní terapie.

2.2.3 Chronobioterapie (léčba jasným světlem, spánkové manipulace, analýzy cirkadiánní rytmicity u duševně nemocných).

2.2.4 Biologické markery a prediktory v oblasti duševních onemocnění.

3. Ústav dědičných metabolických poruch a Klinika dětského a dorostového lékařství

Vykonavatel: prof. MUDr. Jiří Zeman, DrSc.

3.1 Ústav dědičných metabolických poruch

Řešitel: MUDr. RNDr. Pavel Ješina, Ph.D.

3.1.1 Diagnostika dědičných metabolických poruch stanovením nízkomolekulárních metabolitů.

3.1.2 Klinická a laboratorní charakteristika vzácných dědičných metabolických poruch.

3.1.3 Diagnostika lysosomálních střádavých chorob - optimalizace enzymových vyšetření a imunohistochemických metod.

3.1.4 Molekulárně genetická diagnostika dědičných metabolických chorob.

3.2 Klinika dětského a dorostového lékařství, Laboratoř pro studium mitochondriálních poruch
Řešitel: prof. MUDr. Jiří Zeman, DrSc.

3.2.1 Příprava diagnostických kritérií a diferenciálně diagnostických algoritmů mitochondriálních onemocnění.

3.2.2 Optimalizace molekulárně-genetických vyšetření a hledání nových/vzácných příčin mitochondriálního onemocnění a dědičných poruch glykosylace.

3.2.3 Analýza mitochondriálního energetického metabolismu v kontextu celé mitochondrie.

4. III. Interní klinika VFN
Vykonavatel: prof. MUDr. Martin Haluzík, DrSc.

4.1 Význam adipocytárních hormonů u obézních pacientů s/bez diabetes mellitus 2. typu a jejich vztah k metabolickým komplikacím: vliv nízkokalorické diety, laparoskopické sleeve gastrektomie a fyzické aktivity.

4.2 Vliv laparoskopické plikace žaludku na antropometrické a metabolické parametry, na hormonální profil a mRNA expresi vybraných markerů u obézních pacientů s diabetes mellitus 2. typu.

4.3 Adipokiny ve vztahu k méně častým metabolickým komplikacím.

4.4 Optimalizace nových analytických postupů.

5. Trombotické centrum VFN

Vykonavatel: prof. MUDr. Jan Kvasnička, DrSc.

5.1 Registr nemocných s žilní trombózou a plicní embolií zaměřený na detekci genetických a dalších laboratorních znaků trombofilie.

5.2 Registr těhotných žen s trombofilií a profylaxí tromboembolické nemoci v graviditě.

5.3 Registr zdravých osob zaměřený na detekci genetických znaků žilní trombofilie v naší populaci.

5.4 Výzkum geneticky podmíněných poruch hemostázy u osob s kardiovaskulárními chorobami aterosklerotického původu a prevalence těchto poruch v naší populaci.

5.5 Registr nemocných s renální insuficiencí zařazených v čekací listině k transplantaci ledvin - detekce trombofilních mutací.

5.6 Využití farmakogenetiky při sledování efektivity antitrombotické léčby.

5.7 Dědičné trombofilie u nemocných s nádorovými chorobami.

5.8 Experimentální část - celogenomová sekvenace a detekce miRNA.

6. Skupina Centrální výzkumné laboratoře Ústavu lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky, Klinika nefrologie a IV. Interní klinika VFN

Vykonavatel: prof. MUDr. Tomáš Zima, DrSc.

6.1 Centrální výzkumné laboratoře Ústavu lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky
Řešitel: prof. MUDr. Libor Vítek, Ph.D.

6.1.1 Biomarkery kardiovaskulárního rizika u pacientů s onemocněním ledvin.
Řešitel: prof. MUDr. Marta Kalousová, Ph.D.

6.1.2 Studium poruch těhotenství a reprodukce.
Řešitel: Ing. Andrea Kestlerová, MUDr. Jindřich Madar, CSc.

6.1.3 Úsek vyšetřování poruch štítné žlázy, screeningu vývojových vad a Referenční laboratoře pro klinickou biochemii

Řešitel: Ing. Drahomíra Springer, Ph.D.

6.1.3.1 Vyšetřování funkce štítné žlázy v těhotenství.

6.1.3.2 Screening vrozených vývojových vad.

6.1.3.3 Testování glukometrů v Referenční laboratoři pro klinickou biochemii.

6.1.3.4 Stanovení cytokinů a růstového faktoru.

6.1.4 Detekce vybraných nádorových markerů a markerů kardiovaskulárního rizika (hypertenze, srdečního selhání a hypertrofie myokardu) pomocí molekulárně genetických testů.

Řešitel: RNDr. Marie Jáchymová, Ph.D.

6.1.4.1 Vztah biomarkerů kardiální fibrózy k patofyziologii různých typů kardiomyopatií.

6.1.4.2 Neinvazivní parametry v hodnocení portální hypertenze při jaterní cirhóze a jejich význam pro vznik kardiálních komplikací.

6.1.4.3 Vybrané genetické a nutriční faktory v patogeneze metabolického syndromu – význam vícenenasycených mastných kyselin.

6.1.4.4 Uplatnění zjištěné mutace v genu BMPR2 a zátěžové echokardiografie v časné detekci plicní arteriální hypertenze (PAH) u pacientů s dědičnou formou onemocnění.

6.1.5 Studium systémového zánětu u kriticky nemocných - možnosti rychlé diagnostiky sepse a její odlišení od neinfekčního systémového zánětu.

Řešitel: MUDr. Helena Brodská, Ph.D.

6.1.6 Úloha bilirubinu v patogenezi Crohnovy nemoci a kardiovaskulárních nemocí a diabetu.

6.1.7 Úloha produktů katabolické dráhy hemu v kancerogenezi a patogenezi vybraných jaterních chorob.

6.1.8 Laboratoř gastroenterologie ÚLBLD

Řešitel: as. MUDr. Petr Kocna, CSc.

6.1.8.1 Stanovení bakteriálního přerůstání detekcí vodíku a metanu ve vydechovaném vzduchu.

6.2 Klinika nefrologie
Řešitel: Prof. MUDr. Vladimír Tesař, DrSc.

6.2.1 Registr pacientů s ANCA-asociovanou renální vaskulitidou.

6.2.2 Vývoj plicního postižení u ANCA-asociované renální vaskulitidy na základě opakovaných vyšetření HRCT.

6.2.3 IL-33 a ST2 jako biomarker aktivity ANCA-asociované vaskulitidy.

6.2.4 S100 proteiny jako markery aktivity ANCA-asociované vaskulitidy a lupusové nefritidy.

6.2.5 Exprese Toll-like receptorů v ledvinách u pacientů s ANCA-asociovanou vaskulitidou.

6.3 Laboratoř pro výzkum aterosklerózy a Lipidová laboratoř IV. interní kliniky
Řešitel: prof. MUDr. Aleš Žák, DrSc.

6.3.1 Koncentrace necholesterolových sterolů (NCS) a jejich oxidativně modifikovaných derivátů v aortálních chlopních postižených degenerativní stenózou.

6.3.2 Sledování rizikových faktorů a časná diagnostika karcinomu pankreatu.

6.3.3 Časná diagnostika kolorektálního karcinomu.

6.3.4 Biochemické aspekty neurodegenerativních chorob.

7. Skupina Neinvazivní prenatální diagnostika (NPD) a Onkogynekologická chirurgie
Vykonavatel: prof. MUDr. Pavel Calda, Ph.D.

7.1 Gynekologicko-porodnická klinika
Řešitel: prof. MUDr. P. Calda, Ph.D.

7.1.1 Zavedení metod rutinní neinvazivní prenatální diagnostiky (NPD) z mateřské krve do každodenní klinické praxe.

8. Skupina Onkologická chirurgie

    Pracoviště 1. chirurgická klinika
Vykonavatel: prof. MUDr. Zdeněk Krška, CSc.

8.1 Vliv trombofilních faktorů na riziko výskytu pooperační tromboembolické nemoci (TEN) u pacientů indikovaných k plánované operaci pro karcinom v dutině břišní.

8.2 Hodnocení kvality multimodální péče u nemocných s jaterními metastázami kolorektálního karcinomu v rámci komplexních onkologických center ČR. Multicentrická studie.

8.3 Banka biologického materiálu (BBM).

8.4 Lokální ablativní metody (radiofrekvenční ablace a ireversibilní elektroporatizace) s paliativní chemoterapií v léčbě radikálně neoperabilního adenokarcinomu pankreatu.

Víceleté projekty nově plánované

1. Skupina Centrální výzkumné laboratoře Ústavu lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky, Klinika nefrologie a IV. Interní klinika VFN

Vykonavatel: prof. MUDr. Tomáš Zima, DrSc.

1.1 Centrální výzkumné laboratoře Ústavu lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky
Řešitel: prof. MUDr. Libor Vítek, Ph.D.

1.1.1 Genová terapie těžké nekonjugované hyperbilirubinémie.

1.1.2 Laboratoř gastroenterologie ÚLBLD

Řešitel: as. MUDr. Petr Kocna, CSc.

1.1.2.1 The Effect of VSL#3 Probiotic Preparation on the Bile Acid Metabolism in Patients With Inflammatory Bowel Disease.

1.1.2.2 Safeguard - Kardiovaskulární, renální a gastrointestinální účinky inkretinové terapie.

2. Skupina Neinvazivní prenatální diagnostika (NPD) a Onkogynekologická chirurgie
Vykonavatel: prof. MUDr. Pavel Calda, Ph.D.

2.1 Gynekologicko-porodnická klinika
Řešitel: prof. MUDr. P. Calda, Ph.D.

2.1.1 Výzkumné aktivity směřující k nalezení nových markerů k predikci patologií plodu a těhotenství.

2.2 Ústav biologie a lékařské genetiky
Řešitel: Ing. A. Hořínek, Ph.D.

2.2.1 Interpretace genetických nálezů v návaznosti na vývoj zobrazovacích technik.

2.2.2 Zavedení nových molekulárně genetických metod v NPD.

3. Skupina Onkologická chirurgie

 Pracoviště 1. chirurgická klinika
Vykonavatel: prof. MUDr. Zdeněk Krška, DrSc.

3.1 Zlepšení nutričního stavu chirurgických nemocných s maligním onemocněním trávicího traktu (AVKV).

4. Skupina Trombotické centrum ve spolupráci s 1. chirurgickou klinikou

Vykonavatel: prof. MUDr. Jan Kvasnička, DrSc.

4.1. Rychlá diagnostika vybraných markerů systémové zánětlivé reakce ve vztahu k trombotickým komplikacím a sepsi v perioperačním období.

Řešitelé: prof. MUDr. J. Kvasnička, DrSc., as. MUDr. J. Bříza, CSc., prof. MUDr. Z. Krška, DrSc., Mgr. M. Řádek