Odbor vnitřního auditu a kontroly plní ve VFN funkci útvaru interního auditu podle zákona č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě, v platném znění a je přímo podřízen řediteli VFN.

Odbor vnitřního auditu a kontroly:

• provádí interní audity, podle zákona č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě,
• je garantem centrální evidence kontrol VFN ze strany externích kontrolních orgánů,
• je garantem centrální evidence kontrol v rámci vnitřního kontrolního systému VFN,
• vyřizuje a eviduje písemné stížnosti, přijaté VFN v souladu se zákonem č. 372/2011 Sb., o zdravotních službách.

Přínosem činnosti Odboru vnitřního auditu a kontroly jsou zejména přijatá dílčí i systémová opatření k odstranění zjištěných nedostatků, předcházení a řízení detekovaných rizik a zprostředkování informací o výskytu nežádoucích událostí a kvalitě vnitřního kontrolního systému VFN.